Los orígenes de la iglesia del Puerto de Pollença, debemos buscarlos a principios del siglo XX. Concretamente, en 1909, la construcción de la iglesia de Sant Pere fue terminada. En estos momentos, el edificio era una pequeña iglesia situada en primera línea de la costa, al final de la carretera que conectaba con la villa de Pollença.

Con el crecimiento urbanístico y demográfico del Muelle, la iglesia de Sant Pere no fue suficiente para toda la comunidad. Las obras del nuevo templo parroquial se iniciaron en 1934, pero con la Guerra Civil se paralizó el proyecto. No fue hasta 1940 cuando se pudo bendecir la primera fase de la iglesia parroquial del Muelle, que fue construyéndose a lo largo del siglo XX, obra del arquitecto Josep d’Oleza i Frates. En 1996 se acabó de construir el campanario, momento en que se dio por terminada la construcción de la Parroquia.

Su arquitectura y su interior son de una austeridad sobrecogedora, pero de una belleza formal que invita al recogimiento. Como elemento decorativo a destacar, destacan la capilla del Santísimo, obra neorrománica inacabada del arquitecto Josep Ferragut, y una pintura de Hermen Anglada-Camarassa que representa a Jesús calmando la tormenta.